Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1BQ00975 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA1BQ00975 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms