Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDC42EP1Q00587 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC42EP1Q00587 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC42EP1Q00587 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms