Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKL1Q00532 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL1Q00532 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms