Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAT1AQ00266 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms