Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEP78395 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEP78395 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms