Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GNB1P62873 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB1P62873 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB1P62873 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB1P62873 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB1P62873 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB1P62873 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB1P62873 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB1P62873 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB1P62873 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB1P62873 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB1P62873 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB1P62873 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB1P62873 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB1P62873 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB1P62873 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB1P62873 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB1P62873 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB1P62873 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB1P62873 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB1P62873 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB1P62873 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB1P62873 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB1P62873 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB1P62873 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB1P62873 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB1P62873 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB1P62873 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB1P62873 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB1P62873 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB1P62873 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB1P62873 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB1P62873 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB1P62873 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB1P62873 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB1P62873 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB1P62873 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB1P62873 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB1P62873 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB1P62873 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB1P62873 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB1P62873 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB1P62873 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB1P62873 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB1P62873 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GNB1P62873 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB1P62873 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB1P62873 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB1P62873 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB1P62873 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB1P62873 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB1P62873 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB1P62873 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNB1P62873 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNB1P62873 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNB1P62873 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNB1P62873 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNB1P62873 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNB1P62873 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNB1P62873 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNB1P62873 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNB1P62873 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB1P62873 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB1P62873 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB1P62873 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB1P62873 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB1P62873 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNB1P62873 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB1P62873 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB1P62873 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB1P62873 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB1P62873 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB1P62873 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB1P62873 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB1P62873 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB1P62873 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB1P62873 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB1P62873 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB1P62873 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GNB1P62873 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB1P62873 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB1P62873 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB1P62873 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB1P62873 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB1P62873 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB1P62873 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB1P62873 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB1P62873 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB1P62873 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB1P62873 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GNB1P62873 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB1P62873 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB1P62873 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB1P62873 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB1P62873 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB1P62873 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB1P62873 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB1P62873 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB1P62873 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GNB1P62873 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms