Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1CAP62136 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms