Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS2P61201 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPS2P61201 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPS2P61201 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPS2P61201 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPS2P61201 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPS2P61201 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPS2P61201 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS2P61201 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS2P61201 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS2P61201 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS2P61201 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS2P61201 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS2P61201 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS2P61201 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS2P61201 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS2P61201 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPS2P61201 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPS2P61201 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPS2P61201 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COPS2P61201 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COPS2P61201 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS2P61201 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS2P61201 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS2P61201 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS2P61201 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS2P61201 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS2P61201 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS2P61201 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS2P61201 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS2P61201 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS2P61201 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS2P61201 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS2P61201 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS2P61201 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS2P61201 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS2P61201 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS2P61201 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS2P61201 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS2P61201 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS2P61201 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS2P61201 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS2P61201 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS2P61201 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS2P61201 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS2P61201 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS2P61201 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS2P61201 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS2P61201 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS2P61201 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS2P61201 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS2P61201 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS2P61201 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS2P61201 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS2P61201 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS2P61201 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS2P61201 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS2P61201 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS2P61201 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS2P61201 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS2P61201 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPS2P61201 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPS2P61201 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPS2P61201 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPS2P61201 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
COPS2P61201 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS2P61201 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS2P61201 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS2P61201 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS2P61201 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS2P61201 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS2P61201 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS2P61201 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS2P61201 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS2P61201 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS2P61201 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS2P61201 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS2P61201 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS2P61201 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS2P61201 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS2P61201 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS2P61201 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS2P61201 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS2P61201 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS2P61201 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS2P61201 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS2P61201 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS2P61201 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS2P61201 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS2P61201 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS2P61201 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS2P61201 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS2P61201 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS2P61201 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS2P61201 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS2P61201 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPS2P61201 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPS2P61201 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPS2P61201 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPS2P61201 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
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