Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX4P57082 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX4P57082 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX4P57082 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX4P57082 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX4P57082 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX4P57082 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX4P57082 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX4P57082 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX4P57082 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX4P57082 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX4P57082 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX4P57082 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX4P57082 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX4P57082 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX4P57082 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX4P57082 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX4P57082 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX4P57082 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX4P57082 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX4P57082 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX4P57082 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX4P57082 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX4P57082 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX4P57082 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX4P57082 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX4P57082 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TBX4P57082 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TBX4P57082 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TBX4P57082 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TBX4P57082 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TBX4P57082 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TBX4P57082 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TBX4P57082 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TBX4P57082 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TBX4P57082 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TBX4P57082 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TBX4P57082 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TBX4P57082 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TBX4P57082 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TBX4P57082 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TBX4P57082 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TBX4P57082 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TBX4P57082 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TBX4P57082 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TBX4P57082 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TBX4P57082 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TBX4P57082 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TBX4P57082 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TBX4P57082 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TBX4P57082 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TBX4P57082 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TBX4P57082 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TBX4P57082 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TBX4P57082 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TBX4P57082 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TBX4P57082 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TBX4P57082 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TBX4P57082 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TBX4P57082 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TBX4P57082 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TBX4P57082 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TBX4P57082 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TBX4P57082 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TBX4P57082 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TBX4P57082 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TBX4P57082 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TBX4P57082 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TBX4P57082 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TBX4P57082 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TBX4P57082 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TBX4P57082 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TBX4P57082 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TBX4P57082 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TBX4P57082 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TBX4P57082 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TBX4P57082 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TBX4P57082 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TBX4P57082 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TBX4P57082 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TBX4P57082 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBX4P57082 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBX4P57082 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBX4P57082 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBX4P57082 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBX4P57082 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBX4P57082 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBX4P57082 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBX4P57082 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBX4P57082 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBX4P57082 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBX4P57082 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBX4P57082 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBX4P57082 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBX4P57082 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBX4P57082 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBX4P57082 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBX4P57082 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBX4P57082 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBX4P57082 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms