Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRG3P56975 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRG3P56975 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRG3P56975 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRG3P56975 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRG3P56975 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NRG3P56975 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRG3P56975 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRG3P56975 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRG3P56975 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRG3P56975 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRG3P56975 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NRG3P56975 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRG3P56975 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NRG3P56975 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRG3P56975 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRG3P56975 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NRG3P56975 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRG3P56975 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRG3P56975 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRG3P56975 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NRG3P56975 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRG3P56975 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRG3P56975 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRG3P56975 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRG3P56975 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRG3P56975 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRG3P56975 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRG3P56975 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NRG3P56975 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NRG3P56975 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NRG3P56975 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRG3P56975 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRG3P56975 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRG3P56975 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRG3P56975 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRG3P56975 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRG3P56975 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRG3P56975 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRG3P56975 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRG3P56975 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRG3P56975 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRG3P56975 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRG3P56975 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRG3P56975 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRG3P56975 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRG3P56975 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRG3P56975 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRG3P56975 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRG3P56975 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRG3P56975 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRG3P56975 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRG3P56975 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRG3P56975 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRG3P56975 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRG3P56975 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRG3P56975 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRG3P56975 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRG3P56975 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRG3P56975 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRG3P56975 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRG3P56975 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRG3P56975 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRG3P56975 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRG3P56975 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRG3P56975 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRG3P56975 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRG3P56975 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRG3P56975 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRG3P56975 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NRG3P56975 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRG3P56975 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRG3P56975 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRG3P56975 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRG3P56975 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRG3P56975 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRG3P56975 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRG3P56975 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRG3P56975 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRG3P56975 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRG3P56975 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRG3P56975 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRG3P56975 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRG3P56975 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRG3P56975 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRG3P56975 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRG3P56975 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRG3P56975 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRG3P56975 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRG3P56975 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRG3P56975 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRG3P56975 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRG3P56975 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRG3P56975 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRG3P56975 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRG3P56975 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NRG3P56975 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NRG3P56975 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NRG3P56975 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NRG3P56975 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms