Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXG1P55316 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXG1P55316 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXG1P55316 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXG1P55316 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXG1P55316 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXG1P55316 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXG1P55316 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXG1P55316 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXG1P55316 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXG1P55316 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXG1P55316 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXG1P55316 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXG1P55316 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOXG1P55316 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXG1P55316 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXG1P55316 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXG1P55316 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXG1P55316 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXG1P55316 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FOXG1P55316 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXG1P55316 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXG1P55316 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXG1P55316 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXG1P55316 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXG1P55316 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXG1P55316 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXG1P55316 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXG1P55316 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXG1P55316 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXG1P55316 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXG1P55316 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXG1P55316 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXG1P55316 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXG1P55316 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXG1P55316 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXG1P55316 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXG1P55316 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXG1P55316 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXG1P55316 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXG1P55316 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXG1P55316 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXG1P55316 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXG1P55316 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXG1P55316 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXG1P55316 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXG1P55316 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXG1P55316 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXG1P55316 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXG1P55316 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXG1P55316 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXG1P55316 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms