Protein–RNA interactions for Protein: P55283

CDH4, Cadherin-4, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH4P55283 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH4P55283 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH4P55283 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH4P55283 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH4P55283 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH4P55283 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH4P55283 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH4P55283 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH4P55283 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH4P55283 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH4P55283 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH4P55283 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH4P55283 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH4P55283 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH4P55283 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH4P55283 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH4P55283 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH4P55283 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH4P55283 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH4P55283 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH4P55283 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH4P55283 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH4P55283 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH4P55283 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH4P55283 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH4P55283 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH4P55283 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH4P55283 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH4P55283 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH4P55283 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH4P55283 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH4P55283 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH4P55283 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH4P55283 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH4P55283 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH4P55283 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH4P55283 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH4P55283 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH4P55283 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH4P55283 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH4P55283 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH4P55283 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH4P55283 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH4P55283 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH4P55283 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH4P55283 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH4P55283 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH4P55283 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH4P55283 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH4P55283 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH4P55283 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH4P55283 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH4P55283 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH4P55283 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH4P55283 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH4P55283 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH4P55283 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH4P55283 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH4P55283 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH4P55283 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH4P55283 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH4P55283 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH4P55283 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH4P55283 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH4P55283 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH4P55283 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH4P55283 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH4P55283 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH4P55283 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH4P55283 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH4P55283 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH4P55283 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH4P55283 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH4P55283 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH4P55283 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH4P55283 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH4P55283 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH4P55283 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH4P55283 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH4P55283 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH4P55283 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH4P55283 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH4P55283 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH4P55283 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH4P55283 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH4P55283 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH4P55283 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH4P55283 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH4P55283 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH4P55283 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH4P55283 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH4P55283 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH4P55283 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH4P55283 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH4P55283 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH4P55283 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH4P55283 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH4P55283 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH4P55283 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH4P55283 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms