Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRAP54198 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRAP54198 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRAP54198 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRAP54198 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
HIRAP54198 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRAP54198 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRAP54198 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRAP54198 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRAP54198 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRAP54198 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRAP54198 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRAP54198 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRAP54198 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIRAP54198 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIRAP54198 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRAP54198 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRAP54198 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRAP54198 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRAP54198 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRAP54198 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRAP54198 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRAP54198 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRAP54198 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIRAP54198 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRAP54198 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRAP54198 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRAP54198 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRAP54198 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRAP54198 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRAP54198 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRAP54198 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HIRAP54198 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HIRAP54198 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRAP54198 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRAP54198 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HIRAP54198 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIRAP54198 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIRAP54198 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIRAP54198 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIRAP54198 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HIRAP54198 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HIRAP54198 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HIRAP54198 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HIRAP54198 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HIRAP54198 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HIRAP54198 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HIRAP54198 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HIRAP54198 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HIRAP54198 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRAP54198 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRAP54198 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRAP54198 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRAP54198 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HIRAP54198 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRAP54198 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRAP54198 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRAP54198 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRAP54198 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRAP54198 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRAP54198 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HIRAP54198 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRAP54198 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRAP54198 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HIRAP54198 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRAP54198 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HIRAP54198 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRAP54198 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRAP54198 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRAP54198 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRAP54198 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRAP54198 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRAP54198 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRAP54198 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRAP54198 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRAP54198 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRAP54198 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRAP54198 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIRAP54198 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIRAP54198 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIRAP54198 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRAP54198 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRAP54198 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRAP54198 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRAP54198 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRAP54198 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRAP54198 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRAP54198 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRAP54198 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRAP54198 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRAP54198 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRAP54198 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRAP54198 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRAP54198 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRAP54198 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRAP54198 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRAP54198 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRAP54198 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRAP54198 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIRAP54198 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms