Protein–RNA interactions for Protein: P50876

RNF144A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF144AP50876 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF144AP50876 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF144AP50876 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF144AP50876 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF144AP50876 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF144AP50876 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF144AP50876 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF144AP50876 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF144AP50876 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF144AP50876 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF144AP50876 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF144AP50876 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF144AP50876 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF144AP50876 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF144AP50876 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF144AP50876 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms