Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBP50607 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBP50607 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBP50607 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBP50607 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBP50607 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBP50607 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBP50607 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBP50607 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBP50607 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBP50607 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBP50607 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBP50607 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBP50607 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBP50607 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBP50607 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBP50607 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBP50607 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBP50607 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBP50607 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBP50607 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBP50607 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBP50607 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBP50607 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBP50607 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBP50607 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBP50607 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBP50607 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBP50607 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBP50607 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBP50607 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBP50607 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBP50607 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBP50607 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBP50607 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBP50607 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBP50607 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBP50607 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBP50607 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBP50607 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBP50607 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBP50607 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBP50607 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBP50607 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBP50607 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBP50607 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBP50607 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBP50607 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBP50607 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBP50607 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBP50607 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBP50607 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBP50607 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBP50607 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBP50607 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBP50607 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBP50607 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBP50607 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBP50607 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBP50607 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBP50607 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBP50607 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBP50607 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBP50607 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBP50607 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBP50607 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBP50607 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBP50607 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBP50607 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBP50607 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBP50607 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBP50607 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBP50607 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBP50607 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBP50607 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBP50607 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBP50607 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBP50607 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBP50607 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBP50607 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBP50607 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBP50607 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBP50607 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TUBP50607 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBP50607 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBP50607 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBP50607 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBP50607 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBP50607 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBP50607 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBP50607 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBP50607 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBP50607 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBP50607 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBP50607 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBP50607 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBP50607 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBP50607 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBP50607 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBP50607 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms