Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIG4P49917 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIG4P49917 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIG4P49917 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIG4P49917 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIG4P49917 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIG4P49917 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIG4P49917 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIG4P49917 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIG4P49917 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIG4P49917 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIG4P49917 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIG4P49917 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIG4P49917 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIG4P49917 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIG4P49917 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIG4P49917 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIG4P49917 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIG4P49917 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIG4P49917 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIG4P49917 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIG4P49917 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIG4P49917 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIG4P49917 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIG4P49917 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIG4P49917 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIG4P49917 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIG4P49917 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIG4P49917 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIG4P49917 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIG4P49917 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIG4P49917 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIG4P49917 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIG4P49917 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIG4P49917 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIG4P49917 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIG4P49917 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIG4P49917 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LIG4P49917 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIG4P49917 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIG4P49917 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIG4P49917 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIG4P49917 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIG4P49917 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIG4P49917 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIG4P49917 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIG4P49917 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIG4P49917 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIG4P49917 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIG4P49917 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIG4P49917 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIG4P49917 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIG4P49917 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIG4P49917 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIG4P49917 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LIG4P49917 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIG4P49917 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIG4P49917 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIG4P49917 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIG4P49917 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIG4P49917 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LIG4P49917 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LIG4P49917 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIG4P49917 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIG4P49917 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIG4P49917 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIG4P49917 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIG4P49917 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIG4P49917 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIG4P49917 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIG4P49917 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIG4P49917 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIG4P49917 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIG4P49917 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIG4P49917 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIG4P49917 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIG4P49917 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LIG4P49917 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LIG4P49917 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LIG4P49917 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LIG4P49917 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LIG4P49917 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LIG4P49917 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LIG4P49917 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LIG4P49917 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LIG4P49917 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LIG4P49917 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LIG4P49917 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LIG4P49917 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LIG4P49917 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LIG4P49917 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LIG4P49917 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LIG4P49917 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LIG4P49917 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LIG4P49917 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LIG4P49917 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LIG4P49917 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIG4P49917 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIG4P49917 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LIG4P49917 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms