Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLK2P49760 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLK2P49760 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLK2P49760 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLK2P49760 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLK2P49760 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLK2P49760 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLK2P49760 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLK2P49760 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLK2P49760 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLK2P49760 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLK2P49760 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CLK2P49760 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLK2P49760 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLK2P49760 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLK2P49760 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CLK2P49760 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CLK2P49760 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLK2P49760 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLK2P49760 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLK2P49760 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLK2P49760 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLK2P49760 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLK2P49760 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLK2P49760 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLK2P49760 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLK2P49760 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLK2P49760 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLK2P49760 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLK2P49760 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLK2P49760 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLK2P49760 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLK2P49760 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLK2P49760 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLK2P49760 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CLK2P49760 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLK2P49760 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLK2P49760 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLK2P49760 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLK2P49760 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLK2P49760 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLK2P49760 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLK2P49760 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLK2P49760 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLK2P49760 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLK2P49760 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLK2P49760 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLK2P49760 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLK2P49760 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLK2P49760 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLK2P49760 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLK2P49760 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLK2P49760 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLK2P49760 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLK2P49760 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLK2P49760 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLK2P49760 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLK2P49760 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLK2P49760 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLK2P49760 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLK2P49760 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLK2P49760 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLK2P49760 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLK2P49760 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLK2P49760 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLK2P49760 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLK2P49760 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLK2P49760 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CLK2P49760 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLK2P49760 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLK2P49760 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLK2P49760 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLK2P49760 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLK2P49760 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLK2P49760 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLK2P49760 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLK2P49760 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLK2P49760 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLK2P49760 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLK2P49760 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLK2P49760 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLK2P49760 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLK2P49760 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLK2P49760 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLK2P49760 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLK2P49760 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CLK2P49760 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLK2P49760 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLK2P49760 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLK2P49760 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLK2P49760 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLK2P49760 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLK2P49760 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLK2P49760 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLK2P49760 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLK2P49760 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CLK2P49760 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CLK2P49760 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLK2P49760 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLK2P49760 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms