Protein–RNA interactions for Protein: P48723

HSPA13, Heat shock 70 kDa protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA13P48723 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA13P48723 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA13P48723 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms