Protein–RNA interactions for Protein: P48454

PPP3CC, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CCP48454 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP3CCP48454 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP3CCP48454 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP3CCP48454 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP3CCP48454 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP3CCP48454 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP3CCP48454 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP3CCP48454 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3CCP48454 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP3CCP48454 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP3CCP48454 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313.4 ms