Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRGP48443 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRGP48443 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRGP48443 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRGP48443 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRGP48443 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRGP48443 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRGP48443 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRGP48443 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RXRGP48443 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRGP48443 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRGP48443 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRGP48443 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRGP48443 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRGP48443 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRGP48443 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRGP48443 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRGP48443 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRGP48443 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRGP48443 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRGP48443 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RXRGP48443 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RXRGP48443 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RXRGP48443 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RXRGP48443 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RXRGP48443 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RXRGP48443 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RXRGP48443 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RXRGP48443 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RXRGP48443 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RXRGP48443 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RXRGP48443 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RXRGP48443 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RXRGP48443 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RXRGP48443 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RXRGP48443 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RXRGP48443 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RXRGP48443 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RXRGP48443 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RXRGP48443 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RXRGP48443 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RXRGP48443 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RXRGP48443 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RXRGP48443 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRGP48443 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRGP48443 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRGP48443 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRGP48443 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRGP48443 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRGP48443 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRGP48443 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRGP48443 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RXRGP48443 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRGP48443 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRGP48443 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRGP48443 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRGP48443 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRGP48443 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRGP48443 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRGP48443 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RXRGP48443 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRGP48443 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRGP48443 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRGP48443 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRGP48443 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRGP48443 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRGP48443 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRGP48443 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRGP48443 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RXRGP48443 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RXRGP48443 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RXRGP48443 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RXRGP48443 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RXRGP48443 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RXRGP48443 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RXRGP48443 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RXRGP48443 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RXRGP48443 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RXRGP48443 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RXRGP48443 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RXRGP48443 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RXRGP48443 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RXRGP48443 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RXRGP48443 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RXRGP48443 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RXRGP48443 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RXRGP48443 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RXRGP48443 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RXRGP48443 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RXRGP48443 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RXRGP48443 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RXRGP48443 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RXRGP48443 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RXRGP48443 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RXRGP48443 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RXRGP48443 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RXRGP48443 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RXRGP48443 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RXRGP48443 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RXRGP48443 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms