Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP5P45974 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP5P45974 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP5P45974 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP5P45974 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP5P45974 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP5P45974 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP5P45974 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP5P45974 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP5P45974 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP5P45974 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP5P45974 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP5P45974 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP5P45974 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP5P45974 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP5P45974 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP5P45974 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP5P45974 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP5P45974 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP5P45974 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP5P45974 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP5P45974 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
USP5P45974 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP5P45974 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP5P45974 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP5P45974 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP5P45974 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP5P45974 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP5P45974 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP5P45974 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP5P45974 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP5P45974 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP5P45974 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP5P45974 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP5P45974 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP5P45974 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP5P45974 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP5P45974 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP5P45974 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP5P45974 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
USP5P45974 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP5P45974 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP5P45974 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP5P45974 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP5P45974 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP5P45974 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP5P45974 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP5P45974 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP5P45974 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP5P45974 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP5P45974 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP5P45974 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP5P45974 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP5P45974 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP5P45974 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP5P45974 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP5P45974 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
USP5P45974 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
USP5P45974 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP5P45974 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP5P45974 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP5P45974 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP5P45974 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP5P45974 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP5P45974 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP5P45974 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP5P45974 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP5P45974 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP5P45974 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP5P45974 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP5P45974 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP5P45974 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP5P45974 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
USP5P45974 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP5P45974 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP5P45974 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP5P45974 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP5P45974 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP5P45974 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
USP5P45974 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP5P45974 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP5P45974 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP5P45974 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP5P45974 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP5P45974 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP5P45974 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP5P45974 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP5P45974 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP5P45974 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP5P45974 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP5P45974 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP5P45974 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP5P45974 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP5P45974 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP5P45974 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP5P45974 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP5P45974 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP5P45974 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP5P45974 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP5P45974 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms