Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFSF9P41273 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFSF9P41273 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNFSF9P41273 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms