Protein–RNA interactions for Protein: P40938

RFC3, Replication factor C subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC3P40938 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC3P40938 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC3P40938 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC3P40938 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC3P40938 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC3P40938 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC3P40938 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC3P40938 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC3P40938 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC3P40938 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC3P40938 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC3P40938 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC3P40938 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC3P40938 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC3P40938 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC3P40938 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC3P40938 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC3P40938 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC3P40938 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC3P40938 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC3P40938 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC3P40938 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC3P40938 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC3P40938 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC3P40938 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC3P40938 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC3P40938 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC3P40938 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC3P40938 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC3P40938 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC3P40938 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC3P40938 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFC3P40938 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RFC3P40938 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC3P40938 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC3P40938 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC3P40938 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC3P40938 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC3P40938 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC3P40938 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC3P40938 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC3P40938 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC3P40938 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC3P40938 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC3P40938 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC3P40938 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC3P40938 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC3P40938 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC3P40938 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC3P40938 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC3P40938 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC3P40938 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC3P40938 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC3P40938 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC3P40938 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC3P40938 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC3P40938 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC3P40938 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC3P40938 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC3P40938 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC3P40938 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC3P40938 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC3P40938 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC3P40938 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC3P40938 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC3P40938 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC3P40938 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC3P40938 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC3P40938 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC3P40938 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC3P40938 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC3P40938 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC3P40938 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC3P40938 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC3P40938 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC3P40938 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC3P40938 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC3P40938 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC3P40938 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC3P40938 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFC3P40938 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFC3P40938 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC3P40938 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC3P40938 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC3P40938 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC3P40938 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC3P40938 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFC3P40938 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFC3P40938 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RFC3P40938 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFC3P40938 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFC3P40938 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFC3P40938 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFC3P40938 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFC3P40938 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFC3P40938 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RFC3P40938 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFC3P40938 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFC3P40938 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFC3P40938 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms