Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDH1P40925 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDH1P40925 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDH1P40925 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDH1P40925 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDH1P40925 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MDH1P40925 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MDH1P40925 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDH1P40925 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDH1P40925 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDH1P40925 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDH1P40925 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDH1P40925 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDH1P40925 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDH1P40925 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDH1P40925 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDH1P40925 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDH1P40925 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDH1P40925 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDH1P40925 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MDH1P40925 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDH1P40925 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDH1P40925 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDH1P40925 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDH1P40925 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDH1P40925 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDH1P40925 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDH1P40925 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDH1P40925 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDH1P40925 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDH1P40925 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDH1P40925 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDH1P40925 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDH1P40925 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDH1P40925 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDH1P40925 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDH1P40925 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDH1P40925 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDH1P40925 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDH1P40925 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDH1P40925 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDH1P40925 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDH1P40925 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDH1P40925 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDH1P40925 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDH1P40925 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDH1P40925 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MDH1P40925 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDH1P40925 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDH1P40925 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDH1P40925 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDH1P40925 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDH1P40925 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDH1P40925 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDH1P40925 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDH1P40925 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MDH1P40925 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDH1P40925 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDH1P40925 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDH1P40925 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDH1P40925 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDH1P40925 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDH1P40925 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDH1P40925 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDH1P40925 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDH1P40925 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MDH1P40925 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDH1P40925 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDH1P40925 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDH1P40925 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDH1P40925 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDH1P40925 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDH1P40925 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDH1P40925 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDH1P40925 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDH1P40925 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDH1P40925 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MDH1P40925 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDH1P40925 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDH1P40925 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDH1P40925 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDH1P40925 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDH1P40925 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDH1P40925 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDH1P40925 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDH1P40925 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDH1P40925 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDH1P40925 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDH1P40925 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDH1P40925 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDH1P40925 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDH1P40925 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDH1P40925 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDH1P40925 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDH1P40925 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDH1P40925 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDH1P40925 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDH1P40925 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MDH1P40925 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDH1P40925 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms