Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPGP40121 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPGP40121 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPGP40121 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPGP40121 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPGP40121 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPGP40121 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPGP40121 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPGP40121 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPGP40121 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPGP40121 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPGP40121 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPGP40121 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPGP40121 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPGP40121 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPGP40121 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPGP40121 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPGP40121 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPGP40121 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPGP40121 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPGP40121 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPGP40121 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPGP40121 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPGP40121 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPGP40121 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPGP40121 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPGP40121 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPGP40121 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPGP40121 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPGP40121 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPGP40121 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPGP40121 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPGP40121 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPGP40121 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPGP40121 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPGP40121 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPGP40121 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPGP40121 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPGP40121 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPGP40121 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPGP40121 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPGP40121 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPGP40121 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPGP40121 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPGP40121 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPGP40121 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPGP40121 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPGP40121 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPGP40121 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPGP40121 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPGP40121 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPGP40121 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPGP40121 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPGP40121 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPGP40121 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPGP40121 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPGP40121 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPGP40121 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPGP40121 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPGP40121 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPGP40121 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPGP40121 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPGP40121 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPGP40121 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPGP40121 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPGP40121 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPGP40121 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPGP40121 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPGP40121 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPGP40121 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPGP40121 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPGP40121 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPGP40121 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPGP40121 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPGP40121 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPGP40121 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPGP40121 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPGP40121 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPGP40121 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPGP40121 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPGP40121 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPGP40121 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPGP40121 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPGP40121 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPGP40121 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPGP40121 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPGP40121 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPGP40121 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPGP40121 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPGP40121 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPGP40121 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPGP40121 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPGP40121 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPGP40121 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPGP40121 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPGP40121 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPGP40121 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPGP40121 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPGP40121 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPGP40121 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms