Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM23P36406 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM23P36406 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM23P36406 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms