Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCK1P35558 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PCK1P35558 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCK1P35558 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCK1P35558 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCK1P35558 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCK1P35558 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCK1P35558 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCK1P35558 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCK1P35558 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCK1P35558 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCK1P35558 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCK1P35558 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCK1P35558 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCK1P35558 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCK1P35558 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCK1P35558 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCK1P35558 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PCK1P35558 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCK1P35558 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCK1P35558 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCK1P35558 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCK1P35558 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCK1P35558 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCK1P35558 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCK1P35558 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCK1P35558 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCK1P35558 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCK1P35558 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCK1P35558 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCK1P35558 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCK1P35558 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCK1P35558 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCK1P35558 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCK1P35558 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCK1P35558 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCK1P35558 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCK1P35558 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCK1P35558 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCK1P35558 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCK1P35558 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCK1P35558 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCK1P35558 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCK1P35558 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCK1P35558 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCK1P35558 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCK1P35558 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCK1P35558 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCK1P35558 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCK1P35558 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCK1P35558 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCK1P35558 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCK1P35558 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCK1P35558 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCK1P35558 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCK1P35558 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCK1P35558 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCK1P35558 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCK1P35558 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCK1P35558 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCK1P35558 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCK1P35558 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCK1P35558 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCK1P35558 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCK1P35558 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCK1P35558 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCK1P35558 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCK1P35558 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCK1P35558 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCK1P35558 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCK1P35558 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCK1P35558 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCK1P35558 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCK1P35558 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCK1P35558 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCK1P35558 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCK1P35558 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCK1P35558 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCK1P35558 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCK1P35558 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCK1P35558 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCK1P35558 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCK1P35558 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCK1P35558 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCK1P35558 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCK1P35558 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCK1P35558 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCK1P35558 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCK1P35558 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCK1P35558 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCK1P35558 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCK1P35558 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCK1P35558 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCK1P35558 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCK1P35558 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCK1P35558 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCK1P35558 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCK1P35558 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCK1P35558 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCK1P35558 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms