Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER1P34995 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTGER1P34995 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms