Protein–RNA interactions for Protein: P33121

ACSL1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL1P33121 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACSL1P33121 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSL1P33121 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms