Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTX2P32243 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTX2P32243 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OTX2P32243 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OTX2P32243 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OTX2P32243 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTX2P32243 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTX2P32243 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTX2P32243 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTX2P32243 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTX2P32243 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTX2P32243 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTX2P32243 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTX2P32243 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTX2P32243 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTX2P32243 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTX2P32243 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTX2P32243 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTX2P32243 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTX2P32243 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTX2P32243 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTX2P32243 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTX2P32243 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTX2P32243 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTX2P32243 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTX2P32243 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTX2P32243 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTX2P32243 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTX2P32243 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTX2P32243 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTX2P32243 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTX2P32243 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTX2P32243 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTX2P32243 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTX2P32243 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTX2P32243 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTX2P32243 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTX2P32243 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTX2P32243 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTX2P32243 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTX2P32243 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTX2P32243 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTX2P32243 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OTX2P32243 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTX2P32243 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OTX2P32243 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTX2P32243 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OTX2P32243 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTX2P32243 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTX2P32243 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTX2P32243 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTX2P32243 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTX2P32243 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTX2P32243 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTX2P32243 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTX2P32243 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTX2P32243 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTX2P32243 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTX2P32243 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTX2P32243 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTX2P32243 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTX2P32243 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTX2P32243 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTX2P32243 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTX2P32243 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTX2P32243 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTX2P32243 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTX2P32243 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTX2P32243 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTX2P32243 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTX2P32243 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTX2P32243 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTX2P32243 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTX2P32243 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTX2P32243 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTX2P32243 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTX2P32243 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OTX2P32243 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTX2P32243 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTX2P32243 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTX2P32243 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTX2P32243 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTX2P32243 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OTX2P32243 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTX2P32243 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
OTX2P32243 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTX2P32243 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTX2P32243 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTX2P32243 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTX2P32243 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTX2P32243 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTX2P32243 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTX2P32243 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTX2P32243 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTX2P32243 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTX2P32243 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTX2P32243 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTX2P32243 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTX2P32243 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTX2P32243 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196 ms