Protein–RNA interactions for Protein: P31930

UQCRC1, Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRC1P31930 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UQCRC1P31930 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UQCRC1P31930 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UQCRC1P31930 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UQCRC1P31930 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UQCRC1P31930 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UQCRC1P31930 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UQCRC1P31930 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UQCRC1P31930 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UQCRC1P31930 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UQCRC1P31930 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UQCRC1P31930 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UQCRC1P31930 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UQCRC1P31930 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UQCRC1P31930 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UQCRC1P31930 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UQCRC1P31930 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms