Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB4P30926 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB4P30926 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB4P30926 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB4P30926 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB4P30926 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB4P30926 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB4P30926 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB4P30926 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB4P30926 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB4P30926 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB4P30926 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB4P30926 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB4P30926 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB4P30926 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNB4P30926 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB4P30926 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms