Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKLRP30613 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKLRP30613 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKLRP30613 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKLRP30613 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKLRP30613 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKLRP30613 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKLRP30613 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKLRP30613 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKLRP30613 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKLRP30613 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKLRP30613 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKLRP30613 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKLRP30613 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKLRP30613 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKLRP30613 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKLRP30613 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKLRP30613 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKLRP30613 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKLRP30613 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKLRP30613 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKLRP30613 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKLRP30613 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKLRP30613 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKLRP30613 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKLRP30613 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKLRP30613 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKLRP30613 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKLRP30613 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKLRP30613 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKLRP30613 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKLRP30613 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKLRP30613 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKLRP30613 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKLRP30613 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKLRP30613 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKLRP30613 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKLRP30613 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKLRP30613 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKLRP30613 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKLRP30613 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKLRP30613 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKLRP30613 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKLRP30613 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKLRP30613 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKLRP30613 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKLRP30613 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKLRP30613 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKLRP30613 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKLRP30613 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKLRP30613 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKLRP30613 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKLRP30613 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKLRP30613 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PKLRP30613 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKLRP30613 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKLRP30613 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKLRP30613 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKLRP30613 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKLRP30613 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKLRP30613 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKLRP30613 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKLRP30613 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKLRP30613 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PKLRP30613 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKLRP30613 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKLRP30613 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKLRP30613 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKLRP30613 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKLRP30613 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKLRP30613 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKLRP30613 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKLRP30613 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKLRP30613 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKLRP30613 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKLRP30613 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKLRP30613 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKLRP30613 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKLRP30613 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKLRP30613 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKLRP30613 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKLRP30613 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKLRP30613 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PKLRP30613 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PKLRP30613 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKLRP30613 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKLRP30613 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKLRP30613 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKLRP30613 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKLRP30613 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKLRP30613 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKLRP30613 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKLRP30613 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKLRP30613 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKLRP30613 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKLRP30613 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKLRP30613 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKLRP30613 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKLRP30613 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKLRP30613 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms