Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCND3P30281 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCND3P30281 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCND3P30281 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCND3P30281 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCND3P30281 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCND3P30281 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCND3P30281 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCND3P30281 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCND3P30281 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCND3P30281 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCND3P30281 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCND3P30281 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCND3P30281 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCND3P30281 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCND3P30281 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCND3P30281 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCND3P30281 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCND3P30281 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCND3P30281 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCND3P30281 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCND3P30281 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCND3P30281 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCND3P30281 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCND3P30281 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCND3P30281 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCND3P30281 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCND3P30281 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCND3P30281 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCND3P30281 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCND3P30281 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCND3P30281 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCND3P30281 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCND3P30281 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCND3P30281 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCND3P30281 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCND3P30281 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCND3P30281 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCND3P30281 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCND3P30281 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCND3P30281 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCND3P30281 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCND3P30281 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCND3P30281 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCND3P30281 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCND3P30281 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCND3P30281 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCND3P30281 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCND3P30281 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCND3P30281 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCND3P30281 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCND3P30281 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCND3P30281 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCND3P30281 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCND3P30281 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCND3P30281 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCND3P30281 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCND3P30281 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCND3P30281 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCND3P30281 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCND3P30281 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCND3P30281 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCND3P30281 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCND3P30281 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCND3P30281 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCND3P30281 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCND3P30281 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCND3P30281 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCND3P30281 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCND3P30281 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCND3P30281 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCND3P30281 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCND3P30281 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCND3P30281 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCND3P30281 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCND3P30281 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCND3P30281 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCND3P30281 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCND3P30281 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCND3P30281 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCND3P30281 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCND3P30281 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCND3P30281 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCND3P30281 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCND3P30281 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCND3P30281 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCND3P30281 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCND3P30281 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCND3P30281 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCND3P30281 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCND3P30281 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND3P30281 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND3P30281 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND3P30281 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND3P30281 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND3P30281 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND3P30281 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND3P30281 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND3P30281 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND3P30281 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms