Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD1P28289 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD1P28289 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD1P28289 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms