Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR2AP24928 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR2AP24928 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR2AP24928 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR2AP24928 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms