Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP11P24347 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP11P24347 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP11P24347 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP11P24347 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP11P24347 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP11P24347 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP11P24347 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP11P24347 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP11P24347 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP11P24347 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP11P24347 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP11P24347 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP11P24347 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP11P24347 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP11P24347 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP11P24347 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP11P24347 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP11P24347 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP11P24347 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP11P24347 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP11P24347 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP11P24347 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP11P24347 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP11P24347 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP11P24347 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP11P24347 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP11P24347 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP11P24347 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP11P24347 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP11P24347 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP11P24347 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP11P24347 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP11P24347 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP11P24347 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP11P24347 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP11P24347 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP11P24347 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP11P24347 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP11P24347 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP11P24347 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP11P24347 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP11P24347 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP11P24347 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP11P24347 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP11P24347 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP11P24347 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP11P24347 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP11P24347 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP11P24347 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP11P24347 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP11P24347 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP11P24347 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP11P24347 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP11P24347 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP11P24347 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP11P24347 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP11P24347 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP11P24347 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP11P24347 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP11P24347 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP11P24347 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP11P24347 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP11P24347 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP11P24347 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP11P24347 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP11P24347 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP11P24347 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP11P24347 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP11P24347 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP11P24347 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP11P24347 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP11P24347 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP11P24347 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP11P24347 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP11P24347 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP11P24347 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP11P24347 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP11P24347 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP11P24347 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP11P24347 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP11P24347 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP11P24347 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP11P24347 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP11P24347 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP11P24347 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP11P24347 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP11P24347 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP11P24347 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP11P24347 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP11P24347 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP11P24347 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP11P24347 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP11P24347 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP11P24347 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP11P24347 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP11P24347 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP11P24347 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP11P24347 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP11P24347 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms