Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A1P22736 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A1P22736 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms