Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR1P18146 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR1P18146 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR1P18146 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR1P18146 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR1P18146 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR1P18146 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR1P18146 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR1P18146 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR1P18146 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR1P18146 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR1P18146 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR1P18146 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR1P18146 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR1P18146 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR1P18146 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR1P18146 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR1P18146 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR1P18146 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR1P18146 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR1P18146 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR1P18146 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR1P18146 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR1P18146 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR1P18146 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR1P18146 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR1P18146 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR1P18146 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR1P18146 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR1P18146 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR1P18146 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR1P18146 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR1P18146 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR1P18146 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR1P18146 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR1P18146 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR1P18146 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR1P18146 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR1P18146 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR1P18146 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR1P18146 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR1P18146 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR1P18146 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EGR1P18146 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR1P18146 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR1P18146 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR1P18146 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR1P18146 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EGR1P18146 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EGR1P18146 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EGR1P18146 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EGR1P18146 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EGR1P18146 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR1P18146 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR1P18146 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR1P18146 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR1P18146 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EGR1P18146 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EGR1P18146 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
EGR1P18146 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EGR1P18146 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EGR1P18146 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EGR1P18146 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR1P18146 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR1P18146 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR1P18146 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR1P18146 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR1P18146 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGR1P18146 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR1P18146 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR1P18146 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR1P18146 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR1P18146 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR1P18146 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR1P18146 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR1P18146 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR1P18146 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR1P18146 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGR1P18146 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR1P18146 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR1P18146 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR1P18146 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR1P18146 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR1P18146 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR1P18146 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR1P18146 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR1P18146 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR1P18146 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR1P18146 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGR1P18146 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGR1P18146 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGR1P18146 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGR1P18146 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGR1P18146 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGR1P18146 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGR1P18146 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGR1P18146 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGR1P18146 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR1P18146 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR1P18146 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms