Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCAP17252 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms