Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC5A1P13866 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC5A1P13866 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SLC5A1P13866 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms