Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCL4P13236 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL4P13236 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL4P13236 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL4P13236 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL4P13236 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL4P13236 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL4P13236 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL4P13236 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL4P13236 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4P13236 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4P13236 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4P13236 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4P13236 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4P13236 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4P13236 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4P13236 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4P13236 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4P13236 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4P13236 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4P13236 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL4P13236 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL4P13236 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL4P13236 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL4P13236 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4P13236 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4P13236 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4P13236 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4P13236 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4P13236 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4P13236 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4P13236 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4P13236 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4P13236 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4P13236 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4P13236 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4P13236 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4P13236 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4P13236 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4P13236 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4P13236 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL4P13236 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL4P13236 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL4P13236 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL4P13236 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL4P13236 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL4P13236 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL4P13236 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCL4P13236 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCL4P13236 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL4P13236 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL4P13236 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4P13236 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4P13236 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4P13236 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4P13236 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4P13236 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4P13236 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4P13236 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4P13236 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4P13236 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4P13236 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL4P13236 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL4P13236 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL4P13236 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL4P13236 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL4P13236 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL4P13236 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL4P13236 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL4P13236 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL4P13236 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL4P13236 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL4P13236 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL4P13236 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL4P13236 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL4P13236 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL4P13236 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL4P13236 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL4P13236 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL4P13236 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL4P13236 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL4P13236 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL4P13236 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL4P13236 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL4P13236 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL4P13236 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL4P13236 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL4P13236 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL4P13236 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL4P13236 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL4P13236 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL4P13236 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL4P13236 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL4P13236 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL4P13236 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL4P13236 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL4P13236 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL4P13236 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL4P13236 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL4P13236 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms