Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNB1P11230 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNB1P11230 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.5 ms