Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD8BP10966 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD8BP10966 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8BP10966 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8BP10966 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8BP10966 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8BP10966 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8BP10966 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8BP10966 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8BP10966 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8BP10966 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8BP10966 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8BP10966 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8BP10966 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8BP10966 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8BP10966 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8BP10966 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8BP10966 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8BP10966 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8BP10966 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8BP10966 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD8BP10966 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8BP10966 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8BP10966 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8BP10966 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8BP10966 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD8BP10966 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD8BP10966 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CD8BP10966 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD8BP10966 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD8BP10966 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD8BP10966 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD8BP10966 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8BP10966 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8BP10966 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8BP10966 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8BP10966 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8BP10966 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8BP10966 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8BP10966 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8BP10966 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8BP10966 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8BP10966 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8BP10966 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8BP10966 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8BP10966 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8BP10966 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8BP10966 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8BP10966 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8BP10966 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8BP10966 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8BP10966 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD8BP10966 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD8BP10966 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD8BP10966 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD8BP10966 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CD8BP10966 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD8BP10966 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD8BP10966 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD8BP10966 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD8BP10966 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD8BP10966 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8BP10966 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8BP10966 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8BP10966 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8BP10966 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8BP10966 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8BP10966 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8BP10966 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8BP10966 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8BP10966 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8BP10966 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8BP10966 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CD8BP10966 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD8BP10966 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8BP10966 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8BP10966 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8BP10966 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8BP10966 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8BP10966 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8BP10966 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8BP10966 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8BP10966 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8BP10966 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8BP10966 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8BP10966 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8BP10966 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8BP10966 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8BP10966 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8BP10966 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8BP10966 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8BP10966 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8BP10966 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8BP10966 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8BP10966 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8BP10966 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8BP10966 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8BP10966 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8BP10966 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD8BP10966 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms