Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CD28P10747 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD28P10747 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD28P10747 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD28P10747 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD28P10747 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD28P10747 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD28P10747 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD28P10747 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD28P10747 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD28P10747 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD28P10747 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD28P10747 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD28P10747 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD28P10747 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD28P10747 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD28P10747 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD28P10747 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD28P10747 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD28P10747 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD28P10747 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD28P10747 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD28P10747 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD28P10747 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD28P10747 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD28P10747 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD28P10747 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CD28P10747 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD28P10747 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD28P10747 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD28P10747 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD28P10747 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD28P10747 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD28P10747 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD28P10747 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CD28P10747 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CD28P10747 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD28P10747 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD28P10747 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD28P10747 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD28P10747 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD28P10747 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD28P10747 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD28P10747 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD28P10747 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD28P10747 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD28P10747 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD28P10747 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD28P10747 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD28P10747 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD28P10747 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD28P10747 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD28P10747 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD28P10747 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CD28P10747 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD28P10747 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD28P10747 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD28P10747 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD28P10747 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD28P10747 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD28P10747 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD28P10747 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD28P10747 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD28P10747 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD28P10747 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD28P10747 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD28P10747 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD28P10747 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD28P10747 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD28P10747 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD28P10747 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD28P10747 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD28P10747 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD28P10747 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD28P10747 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CD28P10747 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD28P10747 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD28P10747 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD28P10747 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD28P10747 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD28P10747 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD28P10747 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD28P10747 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD28P10747 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD28P10747 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD28P10747 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD28P10747 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD28P10747 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD28P10747 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD28P10747 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD28P10747 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD28P10747 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD28P10747 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD28P10747 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD28P10747 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD28P10747 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD28P10747 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD28P10747 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD28P10747 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD28P10747 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms