Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR89BP0CG08 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPR89BP0CG08 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR89BP0CG08 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms