Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms