Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSL3P1P0C860 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms