Protein–RNA interactions for Protein: P0C091

FREM3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM3P0C091 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FREM3P0C091 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FREM3P0C091 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
FREM3P0C091 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FREM3P0C091 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms