Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC4P09017 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC4P09017 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms