Protein–RNA interactions for Protein: P07949

RET, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETP07949 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETP07949 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETP07949 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETP07949 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETP07949 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETP07949 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETP07949 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETP07949 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETP07949 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETP07949 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETP07949 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RETP07949 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETP07949 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETP07949 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETP07949 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETP07949 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETP07949 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETP07949 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETP07949 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETP07949 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETP07949 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETP07949 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RETP07949 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RETP07949 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETP07949 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETP07949 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETP07949 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETP07949 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETP07949 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETP07949 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETP07949 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETP07949 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETP07949 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETP07949 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETP07949 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RETP07949 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETP07949 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETP07949 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETP07949 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETP07949 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETP07949 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETP07949 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RETP07949 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETP07949 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETP07949 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETP07949 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETP07949 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETP07949 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RETP07949 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETP07949 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETP07949 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RETP07949 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETP07949 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETP07949 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RETP07949 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETP07949 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETP07949 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RETP07949 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RETP07949 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RETP07949 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RETP07949 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RETP07949 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RETP07949 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RETP07949 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RETP07949 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RETP07949 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RETP07949 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RETP07949 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RETP07949 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RETP07949 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RETP07949 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RETP07949 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RETP07949 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RETP07949 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETP07949 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETP07949 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETP07949 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETP07949 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETP07949 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETP07949 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETP07949 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETP07949 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RETP07949 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RETP07949 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RETP07949 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RETP07949 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RETP07949 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RETP07949 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RETP07949 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RETP07949 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RETP07949 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RETP07949 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RETP07949 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RETP07949 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RETP07949 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RETP07949 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RETP07949 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RETP07949 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RETP07949 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RETP07949 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms